1.稻米产业联盟。通过水稻新品种、新技术、新工艺的引进，提升稻米产品品质，通过“海安大米”、“如东大米”等地标品牌打造，推进“味稻”小镇建设。

　　2.果品产业联盟。通过新品种、新技术、新装备的应用，实现品质与效益双提升，促进南通市果品产业化水平再上新台阶。到2022年，建设果品作物标准示范园10个，培育国家驰名商标区域品牌1个。

　　3.蔬菜产业联盟。挖掘如皋黑塌菜、如东大叶菠菜、启海球生菜等传统特色品牌优势，围绕长三角地区高端叶菜需求，依托联盟在蔬菜科技创新、基地建设、精品营销、成果转化等方面经验，带动全市高端蔬菜产业集群发展。

　　4.蛋鸡产业联盟。挖掘联盟在饲料生产、种禽繁育、蛋鸡养殖、蛋品加工销售的全产业链优势，推动全市蛋鸡产业转型升级。到2022年，全市蛋鸡规模化养殖水平达98%，力争将南通市打造成长三角地区蛋鸡产业高地。

　　5.渔业产业联盟。构建从“苗种到商品”、“互联网+新型物流”的全产业链模式。发挥技术装备优势，提升海洋渔业综合实力，向大洋性渔业迈进。

　　6.农村青年创业创新联盟。发挥平台优势，集聚农村青年创业创新英才，构建新型农业经营主体青年创业创新励志沙龙，把联盟打造成农村青年创业共享共建共赢、互助互帮互学的孵化器与助推器。

　　7.生猪产业联盟。联盟以生猪规模企业为基础,市级以上龙头企业为支撑,依托南京农业大学、扬州大学等科研资源，构建南通现代化生猪产业体系。到2022年，形成产前、产中、产后相配套的全省一流生猪产业。

　　8.电子商务联盟。整合利用联盟“资金流、信息流、实物流”优势，共同打造“通吃天下”南通区域特色农产品品牌，带动电子商务集群发展，推动全市农产品网销份额的提升。到2022年，带动形成农产品网销售超50亿元。

　　9.花木盆景产业联盟。拓展联盟市场营销基地与网络建设服务功能，推动花木盆景产业技术集成创新与转型升级，打造长三角区域花卉盆景交易物流和全国知名小微盆景产业基地。